支付机构处理的金额虽然比商业银行处理的数据要小，但是笔数大很多，这体现了监管对支付机构小额便民支付的定位导向。
行业快速发展下，支付机构也被资本市场看好，并不断成为产业巨头布局金融业务的入口。
支付清算协会不完全统计，从2012年京东正式收购网银在线开始，中国支付行业已经发生超过30起并购或融资案例，仅2015年就有20多例。
在央行将收紧支付牌照审批的背景下，支付牌照对资本的诱惑或将持续。2016年，小米科技就收购捷付睿通65%股权，市场消息称小米为本次收购支付了6亿元。
支付安全仍是业内关注的首要问题。相关统计显示，2015年近200家网上商城或支付平台曝出信息被窃。VISA中国区总经理于雪莉介绍：“随着消费者更多的选择线上支付和移动支付，欺诈交易的数量也从线下到线上，犯罪分子、黑客等利用新的技术进行更加复杂的犯罪活动。”
一位大型股份行网络金融部人士表示，以前主要关注业务流程中的操作风险，而如今科技发展带来的风险更大。
此外，当前第三方支付机构实名认证仍有较大提升空间。
据中国支付清算协会统计，截至2015年年底，非银行支付机构开立个人支付账户实名率达到51.07%，比2014年上升8个百分点。未实名的个人账户仍占比48.93%，占比近半。
中国支付清算协会指出，随着今年7月1日《非银行支付机构网络支付业务管理办法》将正式实施，网络支付业务实名认证将进一步规范。
预付卡机构失落，部分机构挪用备付金
相较于爆发式增长的网络支付、移动支付等业务，第三方支付机构中数量最多的预付卡机构显得有些落寞。
《报告》显示，2015年预付卡发行业务量小幅增长，163家预付卡发卡机构合计发卡2.59亿张，金额761.43亿元，较上年分别增长8.37%和2.77%。
当下，受宏观经济低迷、预付卡机构经营战略不完善等因素影响，预付卡行业所依托的企业福利和礼品等空间收窄；同时，线下零售业低迷也使得依托传统商超客户的机构面临交易萎缩的困境。
《报告》指出，在全面“营改增”的背景下，预付卡机构的特性不完全适用新的税收优惠政策，可能形成新的税负负担。行业盈利水平偏低，预付卡机构迫切需要寻找新的发展模式。
部分第三方支付机构在价格大战下，存在挪用备付金、出借牌照等问题，触碰合规底线。另一方面，无牌支付机构借有牌照机构的名义开展业务，其在账户、资金等方面脱离监管，扰乱了行业发展。”
