过去几年，我国农产品冷链物流行业市场规模维持了20%以上的增速，而随着政府和企业的重视以及消费者对健康农产品需求的增加，我国冷链物流市场增长空间巨大。但是由于起步较晚，很多行业问题尚未得到彻底解决，与发达国家相比仍存在较大差距。随着市场、企业的高速扩展，制约冷链物流行业发展的五大问题待解决。
1.冷链体系尚未建成
目前，我国大约85%的肉类、77%的水产品、95%的蔬菜水果在常温下运输销售，每年仅果品腐烂近1200万吨，蔬菜腐烂1.3亿吨，经济损失严重。就发达国家而言，加拿大已经形成完整的农产品冷链物流体系，蔬菜物流损耗仅为5%。我国冷链体系的建立需要政府的大力支持。
2.冷链设施相对陈旧
近年我国冷链基础设施正在迅速增长，但相对于我国庞大的人口基数，冷库及冷藏车等资源的人均占有量仍旧偏低，部分基础设施陈旧且分布不均，亟待升级改造。我国冷链物流主要集中于铁路和公路运输。截至2011年，全国共拥有6152辆铁路冷藏车，不足铁路货车总量的1%。公路冷藏车保有量在5万辆左右，仅占货运汽车的0.3%。从运输情况看，受我国铁路资源等因素限制，铁路冷藏运输与公路冷藏运输难以协同，严重影响冷藏运输效率。
3.第三方冷链物流发展滞后
目前，我国第三方冷链物流发展的基本状况是以食品生产企业为母体的第三方物流企业和独立第三方物流公司共存并进。专业第三方冷链物流占20%左右，以中小企业为主，缺乏行业竞争力。此外，大多数易腐食品的物流都由生产商、加工商和零售商自己操作，阻碍了第三方冷链物流企业的发展。
4.冷链系统标准化有待完善
据不完全统计，分布在不同行业和部门的冷链物流标准已达近200项。但是冷链物流标准化体系建设由部门、地区条块分割管理，制约了冷链物流各相关行业标准化之间的统一性和协调性。
目前，我国冷链管理部门除了国家统一的标准管理机构外，还有交通、铁路、民航、卫生、信息等代表政府的行业部门。而冷链物流行业涉及的各个产业技术组织、科研机构，则分散在各个政府部门、各个行业中，这样就造成相互之间难以交流和配合，不能形成统一的规划。
5.物流信息化水平低下
冷链物流不同于普通物流，其硬件水平和货物运作要求较普通货物具有较强的刚性要求，对于信息化的配置和运营人员的管理水平、应急处理能力都有较高的要求。我国整体物流信息化水平较低，冷链运输行业的信息化现状更是不容乐观。运营人员大多数从普通物流转岗而来，不仅对产品特性不熟悉，而且对于冷链物流的运营要求掌握程度低。因此，冷链物流应急预案能力亟待提高。
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